Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C5C9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C5C9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8C5C9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms