Protein–RNA interactions for Protein: Q8C494

Prr33, Proline-rich protein 33, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr33Q8C494 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prr33Q8C494 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms