Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Zbed4Q80WQ9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed4Q80WQ9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms