Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmc3Q7TQ69 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tmc3Q7TQ69 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tmc3Q7TQ69 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmc3Q7TQ69 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms