Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sbno2Q7TNB8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sbno2Q7TNB8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sbno2Q7TNB8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sbno2Q7TNB8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sbno2Q7TNB8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sbno2Q7TNB8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sbno2Q7TNB8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sbno2Q7TNB8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms