Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms