Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Atp11bQ6DFW5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Atp11bQ6DFW5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Atp11bQ6DFW5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp11bQ6DFW5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms