Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sv2cQ69ZS6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms