Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms