Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EsrrbQ61539 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms