Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift88Q61371 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift88Q61371 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift88Q61371 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ift88Q61371 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ift88Q61371 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift88Q61371 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ift88Q61371 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ift88Q61371 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ift88Q61371 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ift88Q61371 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift88Q61371 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift88Q61371 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ift88Q61371 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift88Q61371 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift88Q61371 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ift88Q61371 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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