Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms