Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trappc1Q5NCF2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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