Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms