Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssbp4Q3U4B1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssbp4Q3U4B1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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