Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam193bQ3U2K0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms