Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms