Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hace1Q3U0D9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hace1Q3U0D9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms