Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3TTL0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3TTL0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3TTL0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3TTL0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3TTL0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3TTL0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3TTL0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3TTL0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms