Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn2bQ0KL01 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms