Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata4Q08369 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms