Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cnn2Q08093 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms