Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cntn3Q07409 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cntn3Q07409 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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