Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Siah2Q06986 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms