Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pax8Q00288 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms