Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr1bP70700 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr1bP70700 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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