Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mmp20P57748 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp20P57748 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp20P57748 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp20P57748 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp20P57748 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp20P57748 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp20P57748 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp20P57748 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mmp20P57748 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp20P57748 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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