Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacnb3P54285 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms