Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms