Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms