Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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