Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax7P47239 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax7P47239 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax7P47239 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax7P47239 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pax7P47239 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax7P47239 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms