Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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VhlP40338 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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VhlP40338 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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VhlP40338 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
VhlP40338 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
VhlP40338 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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