Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms