Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Hoxc11P31313 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Hoxc11P31313 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc11P31313 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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