Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa10P31310 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa10P31310 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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