Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc10P31257 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms