Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atxn10P28658 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atxn10P28658 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atxn10P28658 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atxn10P28658 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atxn10P28658 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atxn10P28658 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atxn10P28658 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atxn10P28658 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atxn10P28658 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Atxn10P28658 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Atxn10P28658 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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