Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms