Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vav1P27870 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vav1P27870 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vav1P27870 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vav1P27870 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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