Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lef1P27782 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lef1P27782 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms