Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms