Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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