Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SftpcP21841 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms