Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcl1P12850 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcl1P12850 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcl1P12850 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cxcl1P12850 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl1P12850 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms