Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PolP11369 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolP11369 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolP11369 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolP11369 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms