Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
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TtrP07309 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TtrP07309 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TtrP07309 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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TtrP07309 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TtrP07309 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TtrP07309 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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TtrP07309 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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TtrP07309 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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TtrP07309 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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TtrP07309 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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