Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms