Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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