Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlkO54988 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SlkO54988 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlkO54988 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms